グリザイアの迷宫这是人类的体内。　　许许多多的细胞勤奋工作的世界。　　某日白细胞(中性粒细胞)与红细胞，遇见了收留迷路乳酸菌的一般细胞。为了将乳酸菌护送至同伴身边，白细胞(中性粒细胞)与一般细胞向肠道出发。　　然而他们却与来者不善的最强敌人重逢。　　「我和你们到底谁才是正义的一方，趁这次弄个清楚吧」　　再次现身的癌细胞。以及遭到坏菌破坏的肠内环境。　　体内遭遇前所未有的大危机！？　　「束手就擒吧 癌细胞！」　　为了守护这个世界，白细胞们(中性粒细胞)向赌上世界命运的大战发起挑战。